Baterie to często najdroższy element roweru elektrycznego. Nowoczesne baterie rowerowe zbudowane są z ogniw litowo-jonowych. Mają one 2 duże zalety: najlepszy stosunek zmagazynowanej energii do swojej masy oraz brak tzw. efektu pamięci.
Przestrzegając kilku reguł, można wydłużyć żywotność baterii ponad dwukrotnie w stosunku do „normalnego” użytkowania.